Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPHP49418 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPHP49418 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms