Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPIAP49247 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPIAP49247 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPIAP49247 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPIAP49247 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPIAP49247 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPIAP49247 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPIAP49247 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms