Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NESP48681 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NESP48681 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NESP48681 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NESP48681 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms