Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms