Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms