Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGM1P36871 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PGM1P36871 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGM1P36871 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms