Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms