Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTX2P32243 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTX2P32243 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms