Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UQCRC1P31930 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms