Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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TSPOP30536 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TSPOP30536 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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