Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms