Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PLNP26678 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PLNP26678 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PLNP26678 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms