Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms