Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2AP24928 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms