Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRGP23470 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms