Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD53P19397 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD53P19397 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD53P19397 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CD53P19397 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD53P19397 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD53P19397 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD53P19397 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD53P19397 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD53P19397 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD53P19397 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD53P19397 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CD53P19397 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD53P19397 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD53P19397 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD53P19397 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD53P19397 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms