Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms