Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCF2P10911 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms