Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSLP07711 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms