Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX6O95503 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX6O95503 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX6O95503 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX6O95503 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX6O95503 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX6O95503 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX6O95503 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX6O95503 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX6O95503 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX6O95503 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX6O95503 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX6O95503 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX6O95503 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX6O95503 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms