Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX4O95219 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX4O95219 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX4O95219 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX4O95219 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX4O95219 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX4O95219 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX4O95219 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX4O95219 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX4O95219 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms