Protein–RNA interactions for Protein: O94900

TOX, Thymocyte selection-associated high mobility group box protein TOX, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOXO94900 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOXO94900 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TOXO94900 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TOXO94900 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms