Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms