Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP4O75161 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms