Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VILLO15195 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VILLO15195 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VILLO15195 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VILLO15195 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VILLO15195 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VILLO15195 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VILLO15195 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms