Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PARP3Q9Y6F1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms