Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MED16Q9Y2X0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms