Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL20Q9Y2M5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms