Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINLQ9Y2I6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINLQ9Y2I6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms