Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPT1Q9Y234 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms