Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGSF9BQ9UPX0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGSF9BQ9UPX0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.8 ms