Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms