Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RARRES3Q9UL19 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RARRES3Q9UL19 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms