Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP3AQ9UFN0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms