Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLKQ9UBT6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLKQ9UBT6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms