Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVK-18Q9QC07 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK-18Q9QC07 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms