Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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MIS18AQ9NYP9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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MIS18AQ9NYP9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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MIS18AQ9NYP9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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MIS18AQ9NYP9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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MIS18AQ9NYP9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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MIS18AQ9NYP9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MIS18AQ9NYP9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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