Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC10Q9NYD6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC10Q9NYD6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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