Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN6Q9NWW5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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