Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDP1Q9NUW8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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