Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMBRD1Q9NUN5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms