Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX15Q9NRS6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms