Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLCO1B3Q9NPD5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO1B3Q9NPD5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms