Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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