Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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RAB9BQ9NP90 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RAB9BQ9NP90 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RAB9BQ9NP90 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RAB9BQ9NP90 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RAB9BQ9NP90 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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RAB9BQ9NP90 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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RAB9BQ9NP90 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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RAB9BQ9NP90 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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RAB9BQ9NP90 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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RAB9BQ9NP90 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB9BQ9NP90 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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