Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC3GQ9HC16 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms