Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ELL3Q9HB65 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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