Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BHLHE41Q9C0J9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms