Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRINP2Q9C0B6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms