Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP74Q9C0B2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms